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專訪新冠病毒變種報(bào)告第一作者:病毒起源說含三層意義,ABC三種類型的真相竟是這樣!

每日經(jīng)濟(jì)新聞 2020-04-14 18:25:54

4月8號,國際知名學(xué)術(shù)期刊《美國科學(xué)院院報(bào)》發(fā)表了一篇題為《冠狀病毒基因組譜系分析》(《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》)的研究報(bào)告,并在社交媒體平臺(tái)上廣為傳播,也引出了“由此是否說明新冠病毒起源于美國?”的猜測。為此,《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者專訪了新冠病毒變種報(bào)告第一作者彼得?福斯特(Peter Forster)教授,聽聽作者講述這一研究的意義究竟何在。

每經(jīng)記者 余佩穎    每經(jīng)編輯 謝欣    

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圖片來源:攝圖網(wǎng)

4月8號,國際知名學(xué)術(shù)期刊《美國科學(xué)院院報(bào)》發(fā)表了一篇題為《冠狀病毒基因組譜系分析》(《Phylogenetic network analysis of SARS-CoV-2 genomes》)的研究報(bào)告(以下簡稱新冠病毒變種報(bào)告)。這份新冠病毒變種報(bào)告分析了從病患身上取得的前160份完整病毒基因組,得出新冠病毒通過突變產(chǎn)生的不同病毒譜系:全球的新冠病毒已經(jīng)變異為A、B、C三種類型。

其中較為原始的毒株A型與在蝙蝠身上發(fā)現(xiàn)的毒株最接近,而A型更常出現(xiàn)在美國和澳洲感染者身上,在武漢更常見的是從A型突變的B型毒株。另外,由B型變異而來的C型主要出現(xiàn)在歐洲。

“由此是否說明新冠病毒起源于美國?”這樣的猜測在社交媒體平臺(tái)甚囂塵上,上述研究的第一作者,劍橋大學(xué)遺傳學(xué)家彼得•福斯特(Peter Forster)教授只得不斷解釋,“目前仍無法就病毒的起源地給出一個(gè)明確的答案。”

春節(jié)前,最初發(fā)現(xiàn)的新冠肺炎病例被指與武漢華南海鮮批發(fā)市場有關(guān),當(dāng)?shù)卣芸鞂⑵潢P(guān)閉。隨著疫情在武漢當(dāng)?shù)乜焖賯鞑?,該市場隨即被曝出長期存在非法售賣野生動(dòng)物的現(xiàn)象。

然而,《柳葉刀》隨后刊發(fā)的一篇研究指出,第一位被診斷出感染新冠肺炎的病例與華南海鮮市場“沒有關(guān)聯(lián)”。“病毒獵手”利普金3月在接受媒體訪談時(shí)也表示,“在武漢華南海鮮市場內(nèi)發(fā)生的是二次傳播,很可能這種病毒在早些時(shí)候就已經(jīng)開始擴(kuò)散了。”

當(dāng)新冠病毒開始在駛向日本橫濱港的鉆石公主號上被發(fā)現(xiàn),在韓國大邱集會(huì)的人群中被發(fā)現(xiàn),在意大利、西班牙、英國、美國,甚至全球被發(fā)現(xiàn)后,研究者得以從數(shù)量眾多的感染病例中提取到更多的新冠病毒基因組。

至此,大眾關(guān)于新冠病毒最初出現(xiàn)的時(shí)間和地點(diǎn)出現(xiàn)了諸多猜測,每一份證明新冠病毒在當(dāng)?shù)卦缬谌ツ?2月已出現(xiàn)的研究,都將“病毒起源地”的討論推至白熱化。

誰是零號病人?誰是中間宿主?哪里才是新冠病毒的起源地?關(guān)于“新冠病毒起源”的這三大疑問縈繞在所有人腦中。為此,《每日經(jīng)濟(jì)新聞》記者(以下簡稱NBD)專訪了新冠病毒變種報(bào)告第一作者彼得•福斯特(Peter Forster)教授,聽聽作者講述這一研究的意義究竟何在。

病毒起源說含三層意義

NBD:您和團(tuán)隊(duì)發(fā)表的這篇關(guān)于新冠病毒基因組的分析引發(fā)了有關(guān)病毒起源地的討論,請問團(tuán)隊(duì)起初著手這項(xiàng)研究,目的是要揭開新冠病毒的什么“未知之謎”?

彼得•福斯特教授:早在2月份的時(shí)候,我們就開始起草研究手稿。而引發(fā)出的一些爭議并非我們開展此研究的目的。在這樣一場大流行病中,全球應(yīng)該一齊行動(dòng)。

團(tuán)隊(duì)做這項(xiàng)研究的一個(gè)關(guān)鍵目標(biāo)是鑒定新冠病毒基因組的原始版(ancestral virus genome),以及重建臨近疫情暴發(fā)時(shí),突變和病毒變體的進(jìn)化樹。我們希望這項(xiàng)基礎(chǔ)研究能被用于應(yīng)用科學(xué),例如,當(dāng)我們理解了病毒究竟是變得更強(qiáng)又或是更弱了,這有助于解釋臨床反應(yīng)上的差異。

NBD:在之前的一則媒體訪談中,您提到目前仍無法就病毒的起源地給出一個(gè)明確的答案。關(guān)于新冠病毒究竟起源哪里,如今還無法解答這一問題的難點(diǎn)在哪里?

彼得•福斯特教授:“起源”有幾層含義。

1、宿主種類。目前推測新冠病毒的自然宿主可能是蝙蝠,或許和穿山甲有關(guān),而關(guān)于新冠病毒的宿主研究已經(jīng)有研究小組在開展。

2、“起源”還可以指人類身上傳播的新冠病毒基因組的原始版,這正是我們在《美國科學(xué)院院報(bào)》發(fā)表這篇研究的重點(diǎn)。我們已經(jīng)確定了A型新冠病毒是原始類型。

如果我們有更多的蝙蝠冠狀病毒基因組,以及更多的在2019年12月前從感染者樣本中分離出的新冠病毒基因組,那么就這一層意義的“起源”,還可能得到進(jìn)一步精確。

3、“起源”的第三個(gè)含義是地理上的。我們發(fā)現(xiàn),一些A型新冠病毒出現(xiàn)在武漢及周邊地區(qū)感染者的身上,但并不是所有最原始的A型新冠病毒都來自該地區(qū),這一證據(jù)僅說明武漢及周邊地區(qū)存在早期傳播。

NBD:在這份研究報(bào)告中,您的團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn),在武漢、中國乃至東亞地區(qū)被更多發(fā)現(xiàn)的是A型新冠病毒的變異版,即B型新冠病毒。而A型病毒,則被更多地發(fā)現(xiàn)于美國和澳大利亞的病例中,其中早期的美國病例有在武漢居住旅行的歷史。
上述研究結(jié)果無法直接定論病毒的起源地,我們該如何進(jìn)一步理解這一結(jié)果?說明了什么?出現(xiàn)上述結(jié)果的原因,僅僅是有關(guān)病毒與當(dāng)?shù)厝嗣庖呦到y(tǒng)之間的作用嗎?

彼得•福斯特教授:在我看來,這(與當(dāng)?shù)厝说拿庖呦到y(tǒng)有關(guān))是一種可能性,應(yīng)當(dāng)使用臨床數(shù)據(jù)進(jìn)行調(diào)查以最終解釋。如果中國和其他國家的研究者能夠利用我們有關(guān)病毒變種的這份研究結(jié)果,輔之以他們的臨床數(shù)據(jù),看看不同的病毒類型是否與病人不同的臨床特征(潛伏期、恢復(fù)時(shí)間、死亡率、病程等)相關(guān),那將會(huì)很有用。

NBD:研究中提到新冠病毒在中國以外的地區(qū)變異速度更快,這是為何?

彼得•福斯特教授:一種可能的解釋是,病毒需要適應(yīng)不同的人群,他們具有不同的免疫系統(tǒng)和不同的等位基因?;蛘?,也許病毒的變異與不同臨床結(jié)果(之間的關(guān)聯(lián))是微弱的,僅僅反映了不同水平的溫度、濕度、紫外線輻射或其他環(huán)境因素的影響。

基因組譜系分析可加速對感染源的搜尋

NBD:您和其他學(xué)者目前還完成了一項(xiàng)涉及1001個(gè)病毒基因樣本的分析,發(fā)現(xiàn)新冠病毒最初感染人類的時(shí)間大致在2019年9月13日至2019年12月7日這個(gè)區(qū)間。為何9月中旬至12月初沒有大批感染者去醫(yī)院?是因?yàn)槟菚r(shí)候的感染者都是無癥狀感染者嗎?

彼得•福斯特教授:這是一種可能性(無癥狀感染者居多)。另一種可能是,在指數(shù)增長之初,數(shù)字(被感染的人數(shù))很低,并沒有引起太多關(guān)注。

NBD:您和團(tuán)隊(duì)在新冠病毒變種報(bào)告中提到,研究結(jié)果可以幫助識(shí)別無記錄的新冠肺炎感染源,然后進(jìn)行隔離,以遏制該疾病在世界范圍內(nèi)進(jìn)一步傳播。具體而言,請問這份研究能如何幫助識(shí)別無記錄的感染源?

彼得•福斯特教授:以意大利的初期感染為例。意大利的1號病人是一名38歲的意大利人,該感染者認(rèn)為自己可能是從一位去過武漢的朋友那里感染的。然而,對其朋友進(jìn)行的幾次新冠病毒測試,結(jié)果都呈陰性。當(dāng)?shù)卦趯ふ覀魅驹吹倪^程中,時(shí)間流逝,很快新冠肺炎開始在意大利傳播。

據(jù)我們的基因網(wǎng)絡(luò),意大利最早的感染案例或可追溯至1月27日被通報(bào)感染的一名德國患者,另一名初期的意大利感染病例則與“新加坡感染群”有關(guān)。

基因組譜系分析加速了對感染源的搜尋,從而保證有效的隔離。當(dāng)各國解除封鎖后,以及需要追蹤和隔離來源不明的零星疫情時(shí),這一應(yīng)用程序可能很快就會(huì)變得重要起來。

NBD:在新冠病毒變種報(bào)告中,最后就其用途寫道,可以在評估新冠病毒感染后的臨床結(jié)果上發(fā)揮作用,還能在治療方案設(shè)計(jì)和疫苗研發(fā)上有所建樹。這份研究報(bào)告將加速目前如火如荼的疫苗研發(fā)進(jìn)程嗎?

彼得•福斯特教授:這是我們目前正在考慮的事情,我們是否能夠作為一個(gè)跨學(xué)科團(tuán)隊(duì)來做出貢獻(xiàn),這將取決于合作者和資金。

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